1099. Estando sitiada nuevamente Valencia, Rodrigo resulta herido por una flecha. El Cid no puede recuperarse de esta herida y muere el 10 de julio.

Según la leyenda, hace prometer a su esposa que cabalgará una última vez a lomos de su caballo Babieca.

Hecho esto y atado su cadáver a su grupa, hace huir despavoridas a las tropas musulmanas.

1101. Babieca no será montado por nadie más, muriendo en este año.

1102. Su esposa Jimena, mantiene el sitio durante tres años.

No pudiendo resistir el empuje almorávide solicita la ayuda de Alfonso VI, quien no puede hacer otra cosa que evacuar la ciudad llevándose consigo el cadáver de Rodrigo, en dirección al Monasterio de San Pedro de Cardeña, donde recibe sepultura.